L'orgue Jacquot-Lavergne a été transféré dans une autre église de Brunoy où il sonne d'ailleurs beaucoup mieux qu'à Saint-Médard, son emplacement primitif. Il s'agit d'un instrument construit après la Seconde guerre mondiale, d'esthétique plutôt symphonique, pourvu d'une transmission pneumatique des notes, et entretenu régulièrement. L'orgue comprend une douzaine de jeux sur 2 claviers/pédalier. Tous les tuyaux sont installés dans 2 boites expressives.